Jerzy Bahr karierę dyplomatyczną w MSZ rozpoczynał w roku 1974 r. W latach 90. był kolejno radcą ds. politycznych Ambasady RP w Moskwie, konsulem generalnym RP w Kaliningradzie (1992–1994), a od 1994 do 1996 zajmował stanowisko dyrektora Departamentu Europejskiego II. Od 1996 do 2001 był ambasadorem RP w Kijowie (z akredytacją także na Turkmenistan), a w latach 2001–2005 w Wilnie.
Od 21 stycznia 2005 do 22 grudnia 2005 był szefem Biura Bezpieczeństwa Narodowego. 19 maja 2006 został powołany na stanowisko ambasadora RP w Rosji. Odwołano go z dniem 30 września 2010. Bahr, który był ambasadorem RP w Moskwie w czasie, gdy miała miejsce katastrofa smoleńska. Zasiadał w Polsko-Rosyjskiej Grupie do Spraw Trudnych.
