Fakt współpracy Matonisa z KGB ujawniło Litewskie Centrum Badań Ludobójstwa i Oporu, publikując we wrześniu tego roku listy kadrowych współpracowników KGB.
Z danych na portalu kgbveikla.lt wynika, że Algirdas Matonis pracował dla KGB w regionie Dzūkija. Jego nazwisko znajduje się na liście kadrowych pracowników w Druskiennikach.
W 2006 r. ówczesny prezydent Litwy Valdas Adamkus otrzymał dokumenty, z których wynikało, że oficerami rezerwy KGB w stopniu kapitana byli m.in. szef litewskich służb specjalnych Arvydas Pocius i szef MSZ Litwy Antanas Valionis.
