Do Narodowego Zasobu Bibliotecznego włączona została część księgozbioru, obejmująca regionalne wydawnictwa z okresu XIX i początku XX wieku, starodruczne panegiryki, kolekcję księdza Stanisława Kujota ze Zbiorów Towarzystwa Naukowego w Toruniu oraz fotografie i grafiki związane z Toruniem i regionem.
Na narodowy zasób biblioteczny składają się materiały cenne pod względem historycznym, naukowym i artystycznym. Dzieła podzielone są na siedem kategorii: kolekcje biblioteczne, publikacje, rękopisy, rysunki, fotografie i filmy, grafiki oraz inne materiały biblioteczne.
O zaliczeniu księgozbioru do NZB decyduje Rada do Spraw Narodowego Zasobu Bibliotecznego, działająca przy ministrze kultury i dziedzictwa narodowego.
Wśród 13 bibliotek, których materiały tworzą NZB, znajdują się m.in.: Biblioteka Jagiellońska w Krakowie, Biblioteka Narodowa w Warszawie, Biblioteka Zakładu Narodowego im. Ossolińskich we Wrocławiu, Biblioteka Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Biblioteka Śląska w Katowicach, Biblioteka Uniwersytecka w Toruniu i Biblioteka Uniwersytecka Katolickiego Uniwersytetu Lubelskiego Jana Pawła II.
Książnica Kopernikańska jest jedną z 15 jednostek organizacyjnych samorządu województwa kujawsko-pomorskiego w dziedzinie kultury.
