Oprócz osłaniania nielegalnego hazardu w miastach obwodu moskiewskiego wobec Czajki publicznie artykułowane są podejrzenia, że koordynatorem procederu wymuszania haraczy za ochronę kasyn był jego syn. Tymczasem rzeczniczka Kremla poinformowała, że rekomendacja Miedwiediewa dla Czajki jest wyrazem zaufania prezydenta. Podkreśliła, że śledztwo w sprawie kasyn trwa i nikt nie może być uznany za przestępcę przed wyrokiem sądu.
Czajka został prokuratorem generalnym w 2006 r. z rekomendacji Władimira Putina. Nadzoruje m.in. dochodzenie w sprawie katastrofy smoleńskiej.
Jak ujawniła "Gazeta Polska" - według prywatnej amerykańskiej agencji wywiadowczej Strategic Forecasting (STRATFOR) Czajka jest powiązany z GRU - rosyjskim wywiadem wojskowym.
Zajmując się sprawą otrucia Aleksandra Litwinienki, Czajka głównym podejrzanym uczynił nie funkcjonariuszy rosyjskich służb specjalnych, ale... Leonida Newzlina – skłóconego z Putinem biznesmena, który uciekł przed ówczesnym prezydentem Rosji do Izraela. Zarzuty postawione przez Czajkę Newzlinowi określono później jako „absurdalne”.
