Węgrzyn w wyborach parlamentarnych w 2007 uzyskał mandat poselski jako kandydat z listy Platformy Obywatelskiej. Startował w okręgu opolskim. Przewodniczył PO w powiecie kędzierzyńsko-kozielskim, zasiadał we władzach krajowych partii. W marcu 2011 regionalny sąd koleżeński PO pozbawił Roberta Węgrzyna z członkostwa w partii po jego publicznej wypowiedzi na temat homoseksualistów: „Z gejami to dajmy sobie spokój, ale z lesbijkami, to chętnie bym popatrzył" –mówił odnosząc się do legalizacji związków homoseksualnych.
Poseł wystąpił następnie z klubu parlamentarnego tej partii. W 2011 jako niezależny bez powodzenia ubiegał się o mandat senator.
Kończąc karierę polityczną Robert Węgrzyn postanowił ubiegać się o prezydenturę w Kędzoerzynie-Koźle. Wczoraj wieczorem poinformował jednak, że ze względu na pogorszenie się stanu zdrowia decyduje się na ograniczenie aktywności politycznej.
- W tej sytuacji nie jestem w stanie zagwarantować, że jako prezydent, zgodnie ze swymi deklaracjami, potrafiłbym pracować na pełnych obrotach od pierwszego do ostatniego dnia kadencji. Tylko takie podejście uważam za właściwe i niejednokrotnie zwracałem uwagę, że bycie prezydentem Kędzierzyna-Koźla na pół etatu to marnowanie potencjału miasta i wyraz braku szacunku dla mieszkańców – cytuje oświadczenie Węgrzyna gazeta.pl.