Podczas swojej podróży do Gruzji i Azerbejdżanu mówił księżom i zakonnicom, że nauczanie teorii gender w szkołach była częścią „globalnej wojny" przeciwko małżeństwu.
Powiedział, że teoria gender nauczana w szkołach „jest niezgodna z prawami naturalny"
– powiedział Ojciec Święty.Jedna kwestia to osoba, która ma tę tendencję, czy nawet chce zmienić płeć. Ale inną sprawą jest nauka o ideologii gender w szkołach, aby zmienić mentalność. Ja nazywam to ideologiczną kolonizacją. Kiedy taka osoba przybędzie do Jezusa, Jezus na pewno nie powie: idź sobie, bo jesteś homoseksualistą. Nie. Mówiąc o tym chodziło mi o to, co robi się dziś z indoktrynacją teorii gender
Franciszek opowiedział historię Hiszpana, który powiedział mu, jak bardzo cierpiał ponieważ czuł się chłopcem w ciele dziewczynki. Ta osoba później przeszła operację zmiany płci i poślubiła kobietę. Ta osoba opisała w liście do Franciszka, ile para wycierpiała, gdy miejscowy ksiądz krzyknął do niego: „pójdziesz do piekła". Franciszek zaprosił ich do Watykanu, aby porozmawiać, a para była zadowolona, że była traktowana z godnością.
– mówił Franciszek.Życie jest życiem, grzech jest grzechem, ale tendencje lub brak równowagi hormonalnej... może być przyczyną wielu problemów i musimy być ostrożni. Każdy przypadek należy przyjąć, towarzyszyć. To jest to, co zrobiłby dzisiaj Jezus.