Głównymi zadaniami stojącymi przed 2 Wojskowym Szpitalem Polowym jest zabezpieczenie medyczne wojsk własnych i sojuszniczych na rzecz których Szpital, oraz podległe mu jednostki działają, a także realizacja zadań wynikających z planów zarządzania kryzysowego.
W celu zapewnienia bezpieczeństwa zdrowotnego żołnierzy i pracowników resortu obrony narodowej powracających z misji poza granicami kraju, na wrocławskim lotnisku wdrożono pracę Rejonowej Wojskowej Komisji Lekarskiej na bazie rozwiniętego Kontenerowego Szpitala Polowego, 2 Wojskowego Szpitala Polowego.
Konsultacje specjalistyczne i badania diagnostyczne wykonywane są przez specjalistów 4 Wojskowego Szpitala Klinicznego przy wsparciu personelu medycznego 2 Wojskowego Szpitala Polowego.