W listopadzie 2011 r. Sąd Apelacyjny w Białymstoku uwzględnił apelację pionu lustracyjnego IPN, który chciał uchylenia wyroku stwierdzającego, iż parlamentarzysta złożył zgodne z prawdą oświadczenie lustracyjne, i zwrotu sprawy do ponownego rozpoznania sądowi pierwszej instancji.
Według Instytutu, Eugeniusz Czykwin złożył niezgodne z prawdą oświadczenie lustracyjne, bo w archiwach byłych służb bezpieczeństwa w latach 80. ubiegłego wieku, figurował, pod dwoma pseudonimami, jako tajny współpracownik.
Poseł Czykwin zaprzecza współpracy.
Dziś powtórzył przed sądem, że nigdy nie współpracował z żadnym służbami PRL.
Nazwisko Czykwina znalazło się w 1992 r. na tzw. liście Macierewicza, która prezentowała zasoby archiwalne po służbach specjalnych PRL. Tam napisano, że Czykwin był tajnym współpracownikiem o pseudonimie Izydor i Wilhelm oraz że figuruje w kartotece ogólnoinformacyjnej UOP.
W październiku Eugeniusz Czykwin po raz kolejny uzyskał mandat z listy SLD z województwa podlaskiego. To współzałożyciel i przewodniczący (lata 1980-85) Bractwa Młodzieży Prawosławnej, założyciel i od 1985 r. - redaktor naczelny "Przeglądu Prawosławnego.
W elektronicznym katalogu IPN na temat posła znajdują się następujące informacje:
Zarejestrowany 23.08.1977 r. pod nr 21661 przez Wydz. III KWMO Białystok w kategorii zabezpieczenie, później zmieniono kategorię na kandydat na TW [brak dokładnej daty przekwalifikowania kategorii rejestracji]. Kolejno był prowadzony przez jednostki operacyjne KWMO Białystok: Wydz. III A i ponownie, od 30.03.1981 r., Wydz. III. 22.10.1982 r. został przejęty na stan Wydz. IV KWMO Białystok. 05.11.1983 r. został przekwalifikowany na TW o ps. „Izydor”. 05.07.1984 r. zmieniono pseudonim na „Wilhelm”. Zdjęty z ewidencji operacyjnej Wydz. IV WUSW Białystok 14.09.1989 r. (na karcie Mkr-2: "Wyeliminowano 13.09.1989 z powodu nieprzydatności."), 2 t. materiałów operacyjnych złożono w Wydz. "C" WUSW Białystok pod sygn. 8510/I, następnie sfilmowano.